No Final da Época 2012/2013
2ª Divisão - 48 Equipas
- Sobem à II Liga o primeiro classificado de cada zona (norte, centro, sul) - 3 clubes
- Descem aos Campeonatos Distritais os dois últimos clubes da cada série (norte, centro, sul) - 6 clubes
3ª Divisão - 94 Equipas
-Sobem ao Campeonato Nacional de Séniores (Ex 2ª Divisão) os dois primeiros classificados de cada série (A, B, C, D, E e F) + Campeão e Vice-Campeão da Série Madeira + Campeão da Série Açores - 15 clubes
- Descem aos Campeonatos Distritais os clubes classificados do 3º aos 12º lugar de cada série (A, B, C, D, E e F) + os restantes clubes da Madeira e Açores
Época 2013/2014 e seguintes
Campeonato Nacional de Séniores - 80 Equipas
1ª Fase
- Dividem-se os clubes em 8 séries de 10 clubes cada
- Jogos a duas voltas
- Os dois primeiros classificados vão jogar na segunda fase para a subida de divisão
- Os restantes jogam para a permanência
2ª Fase
Fase de Subida
- Dividem-se dois primeiros classificados de cada série da 1ª Fase em duas séries - 16 clubes
- Jogos a duas voltas
- Sobem à Liga de Honra os dois primeiros classificados de cada série de 2ª Fase - 2 clubes
- Os clubes classificados em segundo lugar em cada série da 2ª Fase, disputam uma vaga de acesso à Liga de Honra através de dois jogos a disputar entre si - 1 clube
2ª Fase
Fase de Permanência
- Os clubes classificados entre o 3º e 10º lugar da 1ª Fase são divididas em 8 séries de oito clubes cada - 64 clubes
- Jogos a duas voltas
- Os dois últimos classificados de cada uma das oito séries descem aos campeonatos distritais - 16 clubes
- Os clubes classificados no sexto lugar de cada série irão disputar um play-off com os outros sextos classificados, descendo quatro clubes
- Sobem ao Campeonato Nacional de Séniores da época seguinte os 18 vencedores dos Campeonatos Distritais + Madeira + Açores - 20 clubes
- Os clubes classificados no sexto lugar de cada série irão disputar um play-off com os outros sextos classificados, descendo quatro clubes
- Sobem ao Campeonato Nacional de Séniores da época seguinte os 18 vencedores dos Campeonatos Distritais + Madeira + Açores - 20 clubes
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